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国家卫生健康委员会主管 ISSN 1674-9316 CN 11-5908/R
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2025年第16卷第2期
综合生物信息学分析马兜铃致急性肾损伤作用机制的研究
作者

陈锋斌1 赖坤美2 陈志敏2 阮诗玮3 张鹤4 许艳芳2

基金项目

2020年福建省卫生健康青年科研课题资助项目(2020QNA043)

作者单位

1 福建医科大学附属第一医院中医科;2 福建医科大学附属第一医院肾内科 / 血液净化研究中心 / 福建省代谢性慢性肾脏病临床研究中心;3 福建省人民医院肾内科;4 国家区域医疗中心 / 福建医科大学附属第一医院滨海院区病案室

通信作者

许艳芳

摘要

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨马兜铃致急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的作用机制。方法 2022年,通过查询中药系统药理学数据库及分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取马兜铃活性成分,在蛋白质资源(universal protein,UniProt)数据库和瑞士目标预测(Swiss target prediction,Swiss)数据库检索马兜铃活性成分的预测靶标,在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)和人类疾病相关的基因与突变位点信息的数据库(diseaseassociated genes and variants,DisGeNET)检索得到AKI相关靶点;利用Cytoscape软件构建“药物-活性成分-靶点-AKI”的复杂关系网络;借助基因、蛋白质相互作用关系检索工具(search tool for the retrieval of interacting genes/proteins,STRING)平台进一步绘制蛋白质之间的相互作用关系网络;利用R软件对共有靶点基因功能进行富集分析;利用分子对接进行半柔性对接反向验证。结果 共得到马兜铃活性成分9个、靶点292个,AKI作用靶点734个,映射后得到马兜铃致AKI潜在靶点84个;马兜铃“成分-靶点-疾病”相互作用关系网络和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集表明马兜铃致AKI是基于多成分、多基因、多靶点的协同复杂作用;分子对接结果表明由马兜铃中筛选出的活性成分与对应的蛋白靶点具有良好的结合能力。结论 马兜铃不仅调节脂质代谢、内分泌代谢通路,还可以通过调节衰老、肿瘤等通路影响AKI进程。

关键词

马兜铃;急性肾损伤;中药;网络药理学;分子对接;作用机制